Fakultas Kedokteran Universitas Mataram berawal dari sebuah program studi, yaitu Program Studi Pendidikan Dokter (PSPD) yang berdiri pada tanggal 18 Juni 2003.  Program studi ini berkembang menjadi fakultas pada tanggal 25 Agustus 2007.  Fakultas Kedokteran Universitas Mataram merupakan satu-satunya fakultas kedokteran negeri di Provinsi Nusa Tenggara Barat dan telah terakreditasi B oleh BAN-PT.  Pada masa awal berdirinya, Fakultas Kedokteran Universitas Udayana berperan penting dalam mengembangkan pendidikan kedokteran di Fakultas Kedokteran Universitas Mataram.  Kerjasama dengan Fakultas Kedokteran Universitas Udayana terus berlanjut hingga saat ini.  Kerjasama dengan institusi lain, baik di dalam maupun di luar negeri, terus dikembangkan sebagai bagian dari upaya fakultas untuk meningkatkan kemampuan di berbagai bidang kedokteran dan pendidikan kedokteran.

Kegiatan pendidikan tahap akademik dilaksanakan dengan model kurikulum berbasis kompetensi, terutama dilaksanakan di Universitas Mataram yang telah dilengkapi dengan berbagai sarana dan prasarana yang lengkap seperti ruang kuliah, ruang tutorial, ruang praktikum, labolatorium penelitian yang telah dilengkapi dengan perlengkapan yang memadai.Kegiatan tahap profesi dilaksanakan dengan sistem gerbong, terutama dilaksanakan di Rumah Sakit Umum Daerah Provinsi Nusa Tenggara Barat yang merupakan rumah sakit pendidikan utama dan beberapa institusi kesehatan lainnya seperti Rumah Sakit Jiwa Mutiara Sukma, RSUD Patut Patuh Patju, RSUD Praya, Puskesmas Narmada dan Puseksmas Kediri.

Saat ini, lulusan FK Unram telah mencapai 400 orang dan telah terserap bekerja di berbagai intistusi baik pemerintah maupun swasta, tersebar diberbagai kabupaten di propinsi NTB dan berbagai propinsi di Indonesia serta telah banyak yang melanjutkan studi ke jenjang yang lebih tinggi seperti spesialis, S-2 dan S-3. Dokter lulusan FK Unram diharapkan dapat berperan dalam mewujudkan cita-cita pembangunan kesehatan nasional, dengan keunggulan dalam bidang kedokteran kepulauan, serta mampu berdaya saing internasional melalui pelayanan kepada pasien, penelitian dan pendidikan.

Sebagai Fakultas Kedokteran yang cukup kredibel, FK Unram telah mampu memangkan berbagai hibah, baik secara personal oleh mahasiswa dan dosen maupun secara institusional. Hibah yang pernah diraih antara lain hibah HPEQ dari tahun 2011-2013. Pada tahun 2017 ini FK Unram juga berhasil meraih hibah SHERA yang berkerjasama dengan berbagai Fakultas Kedokteran terkemuka di Indonesia seperti Universitas Padjadjaran, dan juga dengan Fakultas Kedokteran terkemuka di luar Negeri seperti Universitas Colorado di Amerika Serikat.